中医治病，讲究辨证论证，理法方一线贯通，才能攻克顽疾。冯教授通过多年的临床实践和数万例病人的临床总结；认为慢性胃肠病是一种脏虚腑实，滞损交结，寒热错杂的复杂病症。治疗应补虚泻实，调理升降，独创“养脏培元 清腑导浊”为根治慢性胃肠病治疗大法。
    胃和肠是人体 消化系统的组成部分，胃肠有病直接影响消化吸收，因而说胃肠病就是中医的脾胃病，内经上云："胃主受纳，脾主运化”一纳一化共同完成消化系统 ，来供给人体所需的营养精微 。故《内经》上说“脾胃为后天之本，生化之源，五脏六腑之大主”，概五脏六精气皆来源于脾胃，故又云：“有胃气则生，无胃气则死”这就说明脾胃是人体性命息息相关的重要脏器，调理脾胃是中医治疗之王道。然而人生活在社会当中，社会因素，精神因素，饮食房劳均可直接或间接影响到脾胃的正常生理功能而发生胃肠疾病。清代医学大家 叶天土云：“脾宜升则健，胃宜降则和，太阴湿土得阳始运；阳明胃土，得阴则安，故脾喜刚燥，胃喜柔润。”东垣大升阳气，其治在脾；仲景急下存阴其治在胃，概脾胃的升降运化功能活动，要靠五脏之气来推动。故明代医家张景岳说，“调五脏即所以治脾胃，脾胃有病宜调五脏”这就是养脏培元的立法根据，概脾胃是人体气机升降的枢纽，脾胃的升降要靠五脏的推动，今情绪抑郁，肝失疏泄，则可横逆而乘脾犯胃，乘脾则发生痛泻之症，于是泄泻腹痛，犯胃则见，胃脘胀痛，撺及两肋，呃逆，反胃，治宜舒肝和胃 或疏肝运脾。肾为胃关，内蕴真阴真阳，真阳生胃土而助运化，真阴滋胃阴助胃通降，故曰：脾胃之阴阳根结于肾。肾阳不足则火不生土，而鸡鸣肾泻；其症见天亮时腹痛腹泻，便中完谷不化，体倦乏力，腰酸腿软，恶寒怕冷，肾阴不滋胃阴则食少纳呆，舌红口干，便干，久治不愈者应滋肾养胃阴。心阳生胃土，可助胃动力，肝阴养胃阴，可生粘膜。大便秘结秘结难下，可调升降主法宣肺，宣肺则气机调畅而便通，清气下陷 生飱泻，补气升提提其病速愈，此乃养脏培元之真谛。实践证明：养脏培元，可增强体质，提高免疫力，调整胃肠动力，再生肠胃粘膜 ，愈疡生肌，调节体内的气血阴阳平衡，防治疾病恶变用。                             
   清腑导浊疗法是根据胃肠的生理特性，宜通不宜滞而设立，有清肠降胃，祛除体内有害病理积滞，消除充血，水肿，糜烂，溃疡，炎症，肠化，增生，防止胃肠恶变的效果。
    经云：“六腑者泻而不藏，以通为用”。胃肠为六腑之一，六腑者宜通不宜滞，而且以降为和，今外感六淫，内伤七情，饮食劳倦，损伤脏腑而致脾胃运化失职，产生病理产物，湿热，寒湿，痰饮，食积，气滞，淤血，而影响脾胃升降，脾不升清，则见肠病，腹泻，痢疾，滞下，肠癖，肠风，脏毒，便秘，脱肛，痔疮，结肠炎，肠功能紊乱，过敏性结肠炎，克隆氏病等等，胃不降浊则见胃疼，胃酸，灼热，打嗝。恶心干哕，呕吐，噪杂，吐血，胃炎，反流性食道炎，消化道溃疡，胆汁反流性胃炎。胃粘膜充血水肿，糜烂，溃疡，  肠腺化生，异型增生，息肉，癌变等。金元大医张子和云：“ 症瘕去而营卫畅，糟粕去而肠腑洁|”汉代学者王充说：“欲得长生，肠中常清，欲得不死，肠无积屎”，养脏培元，清腑导浊，补中有泻，泻中有补，寓补于泻，符合脾胃的生理特性。