冯教授认为本病的基本病变是胃粘膜固有腺体的萎缩，在治疗上要抓住二个方面的关键：一方面阻止腺体的进一步萎缩，一方面促进胃粘膜和腺体的生长和再生。这二种方法都是根本性的治疗。
1。阻止胃粘膜腺体萎缩：胃粘膜腺体萎缩的主要原因之一是胃粘膜的慢性炎症，而在腺体萎缩出现后，胃粘膜的慢性炎症依然存在，所以抑制胃粘膜的慢性炎症就能够阻止腺体的进一步萎缩。按冯教授个人的见解，本病腺体萎缩是正气虚弱的表现；而充血、水肿、糜烂等炎性病变在中医看来则属于湿浊、火热、凝寒、瘀血、水饮、气滞、宿食等邪实现象。根据这一认识，在抑制胃粘膜的炎症时，就要根据具体病情，分别应用祛湿、清热、化瘀、散水、行气、消食的方法。习惯应用芩、连、姜、夏、枳、芍等物，增减剂量，随症治之。药物不多，但一药多效，对其病变的作用可谓面面俱到。无论胃粘膜炎症的原因是什么，都能产生较好的抑制效果。若再根据邪气轻重酌加药味，可以更臻熨帖。
2。促腺体再生：促进胃粘膜和腺体的生长和再生更是慢性萎缩性胃炎的治本之法。抑制胃粘膜炎症可以消除导致腺体萎缩的原因，阻止病变的进一步发展，但是却难以使已经萎缩的腺体再生，难以促进腺体增生。腺体萎缩是正气虚弱的表现，应该用扶正之法。四君、理中、益胃、归脾、黄芪建中等方剂，都可以随症选用。冯教授在临床上习惯应用黄芪、党参、甘草、白术、当归、地黄等物。根据笔者的经验和认识，黄芪、党参、白术、甘草、当归、地黄等药所组成的方剂具有非特异性的促组织再生作用，对机体所有组织细胞，包括皮肤、肌肉、神经、骨质、粘膜、血细胞，它都具有促生长、促再生活性。临床观察到，它对萎缩变薄的胃粘膜和萎缩的胃壁腺体有促再生作用。治疗慢性萎缩性胃炎一定不要忽略了选用这些药物，不要为可能存在的湿、热、瘀等邪实的标象所迷惑，弃而不用。在应用这些药物时，一定要注意剂量，既要注意其绝对剂量，也要注意其相对剂量。古人说“中医不传之秘在于剂量”，这话是有一定道理的。某处方中用没用某种药物，这只是决定疗效的一个方面的因素，还有一个重要方面的因素是用够了没有，用了适当的剂量没有。在该补气的情况下，芪仅10g，草仅3g，何用之有？在用补益药物促腺体再生时，如何应用监制药物也很重要。参、芪、术、草、归、地等物若用之不当，有可能导致“补而致壅”或“气增而热”等副反应。如果谙熟配伍之妙，选用适当的药物监制之，患者服起来便无不适。仲景用苓制术，东垣用橘制芪，古人经验甚多，值得学习和借鉴。妥善处理兼挟的邪气也能避免负反应。有湿祛湿，有水消水，有热清热，有寒散寒，补药之用，何弊之有。如何增损药物剂量，如何选用祛邪药物和监制药物，凡此俱与医者辨证以及用药水平相关。
脉诊、色诊、舌诊等四诊结果对于准确辨证大有帮助。面无热色，面色萎黄，舌色淡，脉软、细、弱，形气不足，这些脉症都高度提示要注重补益。它们的存在不仅是局部的现象，而是全身状况在局部的反映。年龄大者，正气多虚。一般来讲，这些征象说明整个机体的修复与再生机能都是相对低下的，应该补而助之。
